A Nemzeti Környezetügyi Intézet vízvédelmi igazgatási szervként jár el. A NeKI egyebek mellett működteti a zajvédelmi adatbázist, vezeti a hulladékégetőkről és nagytüzelő berendezésekről szóló nyilvántartást, és ellátja az Országos Környezeti Kármentesítési Programmal kapcsolatos feladatokat is.